Здравствуйте
Чтобы задать одинаковый цвет фона для всех секций заголовка делаю так:

myModel = new QSqlTableModel(this);
myModel->setTable("T1");

myView = new QTableView();
myView->setModel(myModel);
myView->verticalHeader()->hide();

myView->setStyleSheet("QHeaderView::section { background-color:green }");

Подскажите, пожалуйста, как задать для n-й секции заголовка один цвет, а для остальных - другой?

Можно переопределить в модели headerData, чтобы он в ответ на Qt::BackgroundRole, возвращал нужный QBrush.
Например:

class CustomModel : public QSqlTableModel {
    public:
        virtual QVariant headerData ( int section, Qt::Orientation orientation, int role = Qt::DisplayRole ) const {            
            if (role == Qt::BackgroundRole) {
                QVariant value;
                if (section == 42)
                    value.setValue (QBrush(Qt::blue));
                else
                    value.setValue (QBrush(Qt::red));
                return value;
            };
            return QSqlTableModel::headerData (section, orientation, role);
        };
};

lanz, у меня не работает то, что вы предлагаете... Вот мой код.

#ifndef MYMODEL_H
#define MYMODEL_H

#include <QSqlTableModel>

class MyModel : public QSqlTableModel
{
    Q_OBJECT
public:
    MyModel(QObject *parent = 0);
    QVariant data(const QModelIndex &index,
                  int role = Qt::DisplayRole) const;
    QVariant headerData(int section,
                        Qt::Orientation orientation,
                        int role = Qt::DisplayRole) const;
};

#endif // MYMODEL_H

#include <QtSql>
#include "mymodel.h"

MyModel::MyModel(QObject *parent) :
    QSqlTableModel(parent)
{
}

QVariant MyModel::data(
        const QModelIndex &index, int role) const 
{
    QVariant value = QSqlTableModel::data(index, role);
    switch (role) {
    case Qt::BackgroundRole:
        if (index.column() == 3)
            return QBrush(Qt::green); //ЭТО РАБОТАЕТ
        else
            return value;
    }
    return value;
}

QVariant MyModel::headerData(
        int section, Qt::Orientation orientation, int role) const 
{
    QVariant value = QSqlTableModel::headerData(section, orientation, role);
    switch (role) {
    case Qt::BackgroundRole:
        if (section == 2)
            return QBrush(Qt::green); //А ЭТО НЕ РАБОТАЕТ
        else
            return value;
    }
    return value;
}

Если верить гуглу - то это не возможно.
Даже тут уже бы подобный вопрос: http://www.forum.crossplatform.ru/index.php?showtopic=5440

Разве что попробовать еще переписать paintEvent у QHeaderView.

https://bugreports.qt-project.org/browse/QTBUG-2474

Это проблема дефолтного стиля.
Например если сделать так

view->verticalHeader ()->setStyle (new QMotifStyle);

то все в порядке.

Не очень спортивно конечно, зато дешево и сердито

Судя по исходникам версии 4.8.4, вы абсолютно правы. Без переопределения функции рисования, этого не добиться со стандартными представлениями.



QMotifStyle вряд ли спасет, если приложение использует другой стиль. Будет коряво выглядеть.

Норм!

И потом - выбор невелик. Либо делать свой стиль под все приложение, либо свой paintEvent, который будет все равно корявый, так как оторван от всех стилей.
EDIT: Либо перегрузить какой нибудь один стиль, чтобы он правильно рисовал хедеры и использовать только его.

Честно скажу, я не умею это делать.

А вот QMotifStyle только для заголовков таблиц очень даже сойдет