Скажите пожалуйста как сделать доступным в Qt Script например метод QFile::close()?

Боюсь напрямую никак. только писать класс-обертку

Т.е. метода, который автоматически создаёт класс-обёртку для класса Qt (для методов) нет. Одной-двумя строчками кода не обойтись и придётся создавать класс-обёртку. И для встроенного в WebKit JavaScript та же история?