Все приложения, созданные в Qt Creator`e запускаются в стиле Win98 или Motif.. хотя работаю в Ubuntu 11.04
Если прописать в main.cpp :

QApplication::setStyle(new QGtkStyle);

то стиль срабатывает, но так приходится прописывать в каждом приложении.
При использовании Desktop компонентов в QML - такая же ерунда, но там уже не пропишешь стиль.

Qt выбирает тот стиль, который считает наиболее подходящим для вашего десктопа. Если его выбор для вашей среды считаете неудачным, можете подискутировать на эту тему с разработчиками. Но жёстко задавать стиль в приложении - не выход. В другой среде ваше приложение будет всегда выглядеть чужеродным. Если так уж хочется иметь стиль отличный от умолчального, то проще менять его при запуске приложения опцией -style

Запусти qtconfig-qt4 из пакета qt4-qtconfig и настрой стиль по-умолчанию.