CMakeLists.txt:

...
find_package(PythonLibs REQUIRED)
...

как можно указать cmake какую версию библиотек использовать(а точнее из каких путей).
собрал Python из исходников, установил.
получилось так:
/usr/local/lib/libpython2.7.a
/usr/local/lib/python2.7/*
/usr/local/include/python2.7/*

помогло следующее:

cmake -DPYTHON_LIBRARY=/usr/local/lib/libpython2.7.a .